میکروسکوپ نیروی اتمی یکی از میکروسکوپ های فوق العاده دقیق برای کاوش سه بعدی سطح اجسام است. برخلاف دستگاه میکروسکوپ الکترونی روبشی (SEM) که تصویر دوبعدی می دهد و اغلب برای وضوح بالا، جسم باید رسانای الکتریکی باشد و یا با یک لایه از طلا پوشش داده شود، این میکروسکوپ بدون توجه به رسانایی و یا نارسانایی جسم، کل سطح نمونه را اسکن می کند و تصویر سه بعدی از پستی و بلندی سطح می دهد. کاربردها: - استفاده در بیوشیمی (تصویربرداری از مولکول های بیولوژیکی، اجزاء سلولی، سلول ها و بافت ها) - شیمی، مهندسی شیمی، علم مواد و نانوتکنولوژی (تصویربرداری از پلیمرها، نانوساختارها و سایر مواد) - در فیزیک و بیوفیزیک (اندازه گیری نیروی بیم نوک سوزن AFM و سطح نمونه) - و بررسی زبری انواع سطوح از قبیل غشا، رنگ، سطح فلزات و ... تاثیر عوامل مختلف بافت گیاهان و ... تعیین ضریب اصطکاک سطوح و ...